Naked Sin e Naked Son se refere à tentativa de Solid Snake de tirar a própria vida no túmulo de seu pai Big Boss depois da derrota de Liquid Ocelot em 2014. Neste mesmo período, Meryl Silverburgh e Johnny Sasaki se casaram e Raiden se reencontrou com sua família. Esses fatos ocorreram um mês depois da queda do Sistema dos Patriotas.
Tudo Começa
Depois de receber permissão para descer em um campo de pouso, o Nomad é usado como capela para o casamento de Meryl Silverburgh e Johnny Sasaki. Roy Campbell finalmente resolve os problemas com sua filha e entrega Meryl para o novo marido. Também estão presentes Otacon, Sunny, Mei Ling, Jonathan e Ed, que atua como mestre de cerimônias e une o casal oficialmente. Antes que o casamento termine, Drebin surge como último convidado e presenteia o casal com uma chuva de flores.
Sem suas nanomáquinas para controlar o efeito do álcool, Drebin fica alterado e inicia uma conversa com Otacon. Ele revela que todos os Drebins são na verdade agentes dos Patriotas, o que explica a facilidade para invadir o Sistema SOP. Os Patriotas permitiam deliberadamente a existências dos traficantes de armas e foram eles que ordenaram que Drebin ajudasse Solid Snake e a Rat Patrol Team 01 na missão para exterminar Liquid. O que os Patriotas não imaginavam era que a missão também resultaria no fim do próprio controle que exerciam sobre a sociedade. Na verdade, Rat Pt. 01 é um anagrama para “PatR10t” (Patriota), o que não deixa dúvidas sobre o verdadeiro financiador da equipe. Drebin também revela para Otacon que não carrega mágoas pelo fim do poder dos Patriotas, pois ele e seus companheiros pretendem fundar uma empresa própria que vai se chamar DREBINS. Em um papo de bêbado, Drebin fala sobre as dívidas profundas que o mundo inteiro adquiriu e que não serão superadas nem por leis de regulação das CMPs. Além disso, ele acredita que tudo vai começar de novo através a ONU, uma organização que Drebin compara com os Patriotas.
Enquanto isso, Sunny faz seu primeiro amigo fora do Nomad e pede para Otacon para presentar o garoto com o Metal Gear Mk. III. Otacon concorda e também diz que Sunny agora pode deixar o Nomad para sempre se quiser. Mas garota só pensa em uma coisa: Snake. Depois que ela pergunta onde Snake está, Otacon fica emotivo e diz que Snake está doente e precisa de um tempo para descansar.
Enquanto isso, Raiden está em um hospital e se recupera da cirurgia que fez para substituir suas partes cibernéticas por próteses mais semelhantes ao corpo humano. Enquanto ele descansa, Rosemary entra no quarta acompanhada de um misterioso garoto. Raiden inicialmente se recusa a falar com ela. Debaixo de lágrimas, Rosemary explica que tanto seu casamento com Roy Campbell quanto seu aborto foram mentiras para proteger Raiden e sua família dos Patriotas. Uma armação que obrigou Campbell a sacrificar sua própria família. Ela também revela que o garoto é o filho de Raiden e se chama John. Ao olhar para o menino, toda a hostilidade e dúvida de Raiden desaparecem. Os três se abraçam e Rosemary promete que nunca mais vai deixar Raiden ir embora.
Pai & Filho
Enquanto isso, Solid Snake visita o túmulo de Big Boss mais uma vez. Depois cair em frente ao túmulo, Snake jura completar sua última missão: tirar a própria vida e assim apagar seus genes da Terra e eliminar a ameaça da mutação do vírus FOXDIE. Depois de fumar seu último cigarro, Snake coloca uma arma na boca e dispara.
Mas no último instante, Snake não consegue seguir com o suicídio e dispara para
cima. O estresse de quase ter morrido cobra seu preço e Snake cai de joelhos e
com as mãos no chão, enquanto sofre com muita dor e mal-estar. É nesse momento
que Snake ouve uma voz dizer: “Isso mesmo. Muito bom. Não há motivo para você
partir ainda. Há quanto tempo, Snake”.
Snake se vira e encontra Big Boss, muito vivo e com o rifle Patriota em suas mãos. Snake fica surpreso e rapidamente recarrega sua arma. Os dois apontam suas armas um para o outro por alguns segundos, mas Big Boss larga seu rifle e facilmente desarma Snake. Big Boss então abraça Snake e diz que não está ali para lutar, pois já é hora de “deixar a arma de lado e viver”. Ele explica que para não precisar ser mantido vivo em uma máquina, seu corpo foi reconstruído por EVA e Ocelot com partes de Liquid Snake e Solidus Snake. O corpo destruído por Liquid Ocelot no Leste Europeu era na verdade o cadáver de Solidus. Ocelot conseguiu o usar o código genético do corpo para acessar o Sistema SOP porque Solidus era um clone perfeito de Big Boss, ao contrário de Solid Snake e Liquid Snake. Big Boss também revela que Big Mama e Naomi Hunter estavam envolvidas no planejamento dos eventos que cercaram a missão de Snake.
Big Boss então explica como Ocelot usou uma combinação de nanomáquinas e psicoterapia para se transformar na “cópia mental de Liquid” e assim enganar o sistema. Ele também reconta a história completa dos Patriotas pelo seu ponto de vista. Quando o vírus abriu a porta para o GW dos Patriotas, Big Boss finalmente conseguiu descobrir a localização de Zero. Ele então mostra para Snake um homem muito idoso preso a uma cadeira de rodas equipada com uma máquina de suporte à vida. Big Boss cita os nomes dos fundadores dos Patriotas que já morreram e afirma que o grupo não será completamente destruído até que ele faça “tudo voltar ao Zero” e envie Zero “de volta ao nada”. Dessa forma, Big Boss desliga o fornecimento de oxigênio e mata Zero.
Com Zero morto, Big Boss se torna o último dos Patriotas. Quando Snake pergunta se ele também “vai voltar ao zero”, Big Boss diz que sim e que não vai precisar fazer isso com as próprias mãos. O vírus FOXDIE injetado em Snake por Drebin matou Ocelot e EVA e também foi programado para matar Big Boss. Ele diz que já começou a sentir os efeitos e conta que foi Naomi quem lhe contou isso e lhe deu os detalhes da missão. Big Boss também diz que Naomi pediu para contar que esse novo FOXDIE substituiu o antigo vírus e assim não existe mais o risco de Snake se tornar uma arma biológica. Mesmo que o novo FOXDIE também sofra mutação, Snake não vai viver o bastante para isso se torne um problema. Snake ajuda seu enfraquecido pai a chegar ao túmulo de The Boss. Ele bate continência para The Boss como fez há cinquenta anos e diz tristemente que esteve morto desde o dia em que precisou matar sua mentora. Big Boss também entende o significado do último pedido de The Boss: ela não falou sobre mudar e unir o mundo como um só, mas sim em deixar o mundo em paz do jeito que ele é. Depois de dividir um último cigarro com seu filho, Big Boss faz um último pedido para que Snake passe o restante de sua vida pacificamente e não desperdice seu tempo com mais guerras. Em suas últimas palavras, Big Boss simplesmente diz: “Isso é bom, não é?”. E assim o maior soldado do Século Vinte morre no túmulo da mulher cujos ideais deram início a tudo e cuja vida e morte o transformaram na pessoa que ele foi. Big Boss parte com Snake ajoelhado ao seu lado.
Essa É Para Você
Algum tempo depois, Otacon se aproxima de Snake e pergunta para onde ele quer ir. Snake decide parar de fumar e diz que só falta uma coisa para fazer: ver esta era terminar e descobrir o que o futuro reserva. Otacon concorda que Snake não vai conseguir passar nada para as próximas gerações e insiste que ele e Sunny vão acompanhar e documentar os últimos dias de seu herói e amigo. Depois de alguma insistência, Snake aceita a companhia dos dois.
Mais tarde, Sunny finalmente consegue fazer ovos perfeitos no Nomad e diz alegremente: “Eles se parecem com o sol. E o sol vai nascer novamente”.
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