Metal Gear Solid 2 se divide en dos capítulos: el capítulo del buque y el capítulo de la planta, que transcurren en el buque U.S.S. Discovery y la planta Big Shell, respectivamente. A continuación está la lista completa de lugares de ambos capítulos.
Capítulo del buque
Afueras
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Deck-A
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Deck-B
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Deck-C
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Deck-D
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Deck-E
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Sala de máquinas
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Deck-2
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Bodega
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Capítulo de la planta
Strut-A
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Strut-B
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Strut-C
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Strut-D
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Strut-E
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Strut-F
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Strut-L
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Shell-1 Core
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Shell-2 Core
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Puentes de conexión
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Arsenal Gear
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Manhattan
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