RESUMEN DE FÁCIL COMPRENSIÓN (Metal Gear Solid 2 explicado en tres párrafos):
Parte 1. Los Patriots infiltran a Ocelot con un grupo de élite soviético que quiere robar un modelo de Metal Gear que está a bordo de un barco. El objetivo de Ocelot es hacerse con el Metal Gear para llevárselo a los Patriots, que es lo que ocurre finalmente.
Parte 2. La plataforma Big Shell es tomada por un comando de élite americano conocido como Dead Cell. Con Solidus Snake a la cabeza (ex Patriot y ex presidente de EE.UU) pasan a llamarse Sons of Liberty. Desvían la atención haciéndose pasar por terroristas cuando su único objetivo es desconectar un dispositivo de Inteligencia Artificial (que está en el Big Shell) que recoge toda la información mundial y está al servicio de los Patriots.
Raiden (enviado por los Patriots) y Snake se enfrentan a los Sons of Liberty pensando que son terroristas y que quieren matar al presidente y atentar contra Nueva York con una bomba aérea que anulará todo sistema electrónico de Manhattan. Los dos protagonistas poco a poco irán descubriendo la verdad aunque serán rivales igualmente tanto de Revólver Ocelot como de Solidus Snake por su manera (caiga quien caiga) de enfocar el problema que suponen los Patriots.